Podívej se podle datasheetu FTDIčka, kteé piny to jsou, jestli jsou dobře připájené a jestli se výrobce obtěžoval natáhnout od nich dráhy k padům pro dráty. Pokud je vše správně vodivé a přes to signály nepůjdou, můžeš ještě zkusit jiný software (třeba hercules) a nahodit/shodit s ním signály. Pokud to ani tak nepůjde, tak ještě můžeš zkusit jiný ovladač, nebo třeba i jiný PC (jestli není zakopaný pes v OS nebo přece jenom v ovladači) a pak už zbývá jen vadný FTDI. Jestli máš jiný modul s FTDI, zkus ten, kdyby chodil, určíš jednoznačně problém v tom prvním.
Jako že potřebuješ jen derivační impuls pro reset, že tvůrce programu se neobtěžoval vygenerovat reset od DTR softwarově, ale jen shodí úroveň z 1 do 0? To je tedy fuj řešení, je ošetřen opačný impuls, nebo když jde DTR do 1, tak MCU schytá do resetu 2 x napětí a věří se, že to substrátové diody zvládnou?
Je to myšleno tak, že kdybys chtěl odpojit reset, proškrábneš tu bypassovací dráhu a kdybys to pak chtěl zase uvést do původního stavu, propájíš propojku, běžně takovouto bypassovací dráhu routuji přímo přes propojku, takže je defaultně propojená, při proškrábnutí rozpojená a propájením opět propojitelná a při tom bypass nezabírá místo na DPS navíc. Vývod Reset MCU bych přivedl přes schottky diodu na Vcc, to by mělo stačit, pokud je tedy dostatečně tvrdý pullup, schottky diody mají v závěrném směru dost svod, ale zase potřebuješ diodu s menším úbytkem, než mají substrátové.